微生物的分类，主要包括：细菌、病毒、真菌等三种。
细菌：一类细胞细短，结构简单，胞壁坚韧，多以二分裂方式繁殖和水生性强的原核生物。
病毒：一类由核酸和蛋白质等少数几种成分组成的“非细胞生物”。
真菌：一种具真核的、产孢的、无叶绿体的真核生物。
微生物是一类非常小的生物体，包括细菌、真菌、病毒、藻类等，它们的体积微小，通常只有数微米或几十微米。微生物具有极强的生命力，其代谢活动可以产生大量有用的物质，同时也可以产生有害的代谢产物。微生物在生态系统中发挥着重要的角色，例如维护土壤质量、分解有机物、促进食品发酵等，同时也是很多传染病的病原体。因此，对微生物的认识和研究对于人类的健康、环境保护和科学研究都具有重要意义。
微生物菌剂和多菌灵在作用机理、应用方向、对环境的影响、安全性等方面存在区别。以下是相关介绍：
1、作用机理不同。多菌灵是一种化学农药，主要通过杀灭病原真菌的细胞，阻断其生长繁殖过程来防治病害；微生物菌剂则使用特定的微生物菌株，使其产生对害虫或病原菌具有致病性的代谢产物，利用微生物之间的竞争作用和调节作用来控制病虫害的发生。
2、应用方向不同。多菌灵一般应用于植物真菌病害的防治，如辣椒疮痂病、白菜黑穗病、香椿炭疽病等，也可以用于农作物发芽前的预防处理；微生物菌剂则可以用于植物病虫害和土壤微生物的调节，例如青霉素链霉素可以用于病毒防治，放线菌可以用于对土壤传播的真菌进行防治。
3、对环境的影响不同。多菌灵是一种化学农药，使用过程中可能会对环境和人体健康带来一定的威胁，因此在使用过程中需要严格按照标准剂量和规范使用，确保农产品质量安全；微生物菌剂则对环境污染较小，同时微生物对土壤及植物的生长有一定的刺激作用，有利于土壤的改良和作物的增产。
4、安全性不同。多菌灵是化学合成的农药，存在一定的毒性，对人畜以及环境的安全性存在隐患；微生物菌剂则是天然产生的菌类，使用安全可靠。