管理权应该按照协议分配。
因为在这种情况下，公司不存在股权多数派的情况，必须通过协议来确定公司的管理权归属。
协议应该明确规定各股东在公司管理方面的职权分配，如CEO任命权、财务决策权等等。
此外，协议也应该规定股东委派代表参加董事会会议时的投票方式，避免因不同意见而导致管理困难。
两个股东股权各占50%一般平均分配股权,根据相关规定,在公司章程和协议没有约定的情形下,应当按照股东的的出资比例分配股权,章程或协议有约定的,按其约定。
1、股东之间可以充分进行协商；
2、对于一般事项，需要半数股东的同意；
3、对于重大事项，需要三分之二以上的多数通过。股东可以充分表达其意见、互相尊重、协商达成一致。