嗯，关于论文目录生成时参考文献不显示的问题，这可能是由于多种原因导致的。我来给你分析一下可能的原因，并给你一些建议，希望能帮助你解决问题。

首先，参考文献的格式可能不正确。确保你使用的参考文献格式符合你所在学科或期刊的要求。有时候，如果格式不对，目录生成工具可能无法正确识别参考文献，导致它们无法在目录中显示。

其次，你可能没有正确地将参考文献添加到目录生成工具的范围内。确保在生成目录时，你已经将包含参考文献的部分（通常是文档的最后一部分）包含在内。如果参考文献不在目录生成的范围内，它们自然就不会出现在目录中。

另外，有时候目录生成工具可能会遇到一些技术问题或bug，导致参考文献无法正确生成。如果你怀疑是这种情况，可以尝试重新启动文档编辑软件或电脑，然后再次尝试生成目录。

最后，如果你使用的是特定的文档编辑软件（如Word等），确保你了解并遵循了该软件中关于目录生成和参考文献插入的指南。有时候，软件的不同版本或设置可能会影响目录的生成。

希望这些建议能对你有所帮助。如果问题仍然存在，你可能需要查阅更多关于你使用的文档编辑软件或目录生成工具的教程或帮助文档，或者寻求专业人士的帮助。