1、清洁
刚入手的菩提根需要先进行清洁，清洁的方法是用搓澡巾或佩戴棉质手套反复揉搓，每天揉搓30～60分钟并坚持一周左右，这样可以将菩提根表面的蜡层和灰尘都去除，同时也可以对菩提根打磨抛光。
2、静置
清洁干净的菩提根需要放置一周，让菩提根自然干燥，同时也让菩提根表面均匀和空气接触并形成一层细密的氧化保护膜，这样对于菩提根包浆很有帮助。
3、包浆
静置后的菩提根可以每天上手盘玩30分钟左右，盘玩过程中需要保证菩提根每个角落都要盘到，这样可以防止菩提根出现色差。一般在坚持盘玩1～2周后，菩提根表面会形成薄薄的包浆，之后放置一周至包浆硬化，再坚持盘放结合的方式即可。
选择菩提根质量好的关键是要注意颜色、香气、口感和外观。优质的菩提根呈乳白色，没有色泽过深或不均匀的斑点；香气芬芳且没有刺鼻味道；口感清新且略微甜味，嚼起来有咀嚼感；外观呈卷曲状且有光泽。可以选择来自正规厂家的产品，避免购买来路不明的菩提根。
在购买前可以先闻闻香味、观察颜色和外观，如果条件允许，也可以品尝一下口感，以此来挑选质量好的菩提根。
如果从价值方面比较，菩提子要比菩提根好。因为菩提根产量很高且大多都品质很好，所以造成菩提根一直价格不高。
如果从性价比方面比较，菩提根比菩提子好。因为菩提子品质差距比较大，高品质的菩提子比第品质的菩提子贵数倍甚至数十倍。